Efter en snak med Aslain, giver det hele mere mening for mig.. var ikke klar over der blev lavet en "mods" folder, ud over res_mods. :)
Det der er sket er at Aslain's pakke installere JGSME og laver mods mappen, når man installere skins.
Når man så uninstallere, ja, så ryger JGSME og mods mappen igen.
Så bug var det ikke, men derimod meningen - men dette bliver ændret nu, da man jo, som i dit tilfælde, kan have andre skins end dem fra Aslain's pakke, så nu bliver den mappe efterladt. (Så må folk jo bare selv slette den, selvom de ikke bruger skins fra andre steder)